ResearchPad - update https://www.researchpad.co Default RSS Feed en-us © 2020 Newgen KnowledgeWorks <![CDATA[The HOME Study: Statistical and economic analysis plan for a randomised controlled trial comparing the addition of Proactive Psychological Medicine to usual care, with usual care alone, on the  time spent in hospital by older acute hospital inpatients]]> https://www.researchpad.co/article/elastic_article_12729 Prolonged acute hospital stays are a problem for older people and for health services. Failure to effectively manage the psychological and social aspects of illness is an important cause of prolonged hospital stay. Proactive Psychological Medicine (PPM) is a new way of providing psychiatry services to medical wards which is proactive, focussed, intensive and integrated with medical care. The primary aim of PPM is to reduce the time older people spend in hospital because of unmanaged psychological and social problems. The HOME Study will test the effectiveness and cost-effectiveness of PPM.Methods/designThe study is a two-arm, parallel-group, randomised, controlled superiority trial with linked health economic analysis and an embedded process evaluation. The target population is people aged 65 years and older admitted to acute hospitals. Participants will be randomly allocated to either usual care plus PPM or usual care alone. The primary outcome is the number of days spent as an inpatient in a general hospital in the month following randomisation. Secondary outcomes include quality of life, cognitive function, independent functioning, symptoms of anxiety and depression, and experience of hospital stay. The cost-effectiveness of usual care plus PPM compared with usual care alone will be assessed using quality-adjusted life-years as an outcome as well as costs from the NHS perspective.DiscussionThis update to the published trial protocol gives a detailed plan of the statistical and economic analysis of The HOME Study.Trial registrationISRCTN registry, ISRCTN86120296. Registered on 3 January 2018. ]]> <![CDATA[Global COVID-19 snapshot with focus on top five]]> https://www.researchpad.co/article/elastic_article_9251 <![CDATA[OPTimal IMAging strategy in patients suspected of non-traumatic pulmonary disease at the emergency department: chest X-ray or ultra-low-dose chest CT (OPTIMACT) trial—statistical analysis plan]]> https://www.researchpad.co/article/elastic_article_9167 A chest X-ray is a standard imaging procedure in the diagnostic work-up of patients suspected of having non-traumatic pulmonary disease. Compared to a chest X-ray, an ultra-low-dose (ULD) chest computed tomography (CT) scan provides substantially more detailed information on pulmonary conditions. To what extent this translates into an improvement in patient outcomes and health care efficiency is yet unknown. The OPTimal IMAging strategy in patients suspected of non-traumatic pulmonary disease at the emergency department: chest X-ray or ultra-low-dose chest CT (OPTIMACT) study is a multicenter, pragmatic, non-inferiority randomized controlled trial designed to evaluate replacement of chest X-ray by ULD chest CT in the diagnostic work-up of such patients, in terms of patient-related health outcomes and costs. During randomly assigned periods of 1 calendar month, either conventional chest X-ray or ULD chest CT scan was used as the imaging strategy. This paper presents in detail the statistical analysis plan of the OPTIMACT trial, developed prior to data analysis.Methods/resultsFunctional health at 28 days is the primary clinical outcome. Functional health at 28 days is measured by the physical component summary scale of the Short Form (SF)-12 questionnaire version 1. Secondary outcomes are mental health (mental component summary scale of the SF-12), length of hospital stay, mortality within 28 days, quality-adjusted life year equivalent during the first 28 days (derived from the EuroQol five-dimension, five-level instrument), correct diagnoses at emergency department discharge as compared to the final post hoc diagnosis at day 28, number of patients in follow-up because of incidental findings on chest X-ray or ULD chest CT, and health care costs.ConclusionsAfter this pragmatic trial we will have precise estimates of the effectiveness of replacing chest X-ray with ULD chest CT in terms of patient-related health outcomes and costs.Trial registrationNetherlands National Trial Register: NTR6163. Registered on 6 December 2016. ]]> <![CDATA[Biopanning data bank 2018: hugging next generation phage display]]> https://www.researchpad.co/article/elastic_article_7250 The 2018 update of the biopanning data bank (BDB) stores phage display data sequenced by Sanger sequencing and next generation sequencing technologies. In this work, we upgraded the database with more biopanning data sets and several new features, including (i) incorporation of next generation biopanning data and the unselected population where the target is not determined and the round of screening is zero; (ii) addition of sequencing information; (iii) improvement of browsing and searching systems and 3 D chemical structure viewer; (iv) integration of standalone tools for target-unrelated peptides analysis within conventional phage display and next generation phage display (NGPD) data. In the current version of BDB (released on 19 January 2018), the database houses 3291 sets of biopanning data collected from 1540 published articles, including 95 NGPD data sets and 3196 traditional biopanning data sets. The BDB database serves as an important and comprehensive resource for developing peptide ligands.

Database URL: The BDB database is available at http://immunet.cn/bdb

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<![CDATA[HTT-DB: new features and updates]]> https://www.researchpad.co/article/elastic_article_7248 Horizontal Transfer (HT) of genetic material between species is a common phenomenon among Bacteria and Archaea species and several databases are available for information retrieval and data mining. However, little attention has been given to this phenomenon among eukaryotic species mainly due to the lower proportion of these events. In the last years, a vertiginous amount of new HT events involving eukaryotic species was reported in the literature, highlighting the need of a common repository to keep the scientific community up to date and describe overall trends. Recently, we published the first HT database focused on HT of transposable elements among eukaryotes: the Horizontal Transposon Transfer DataBase: Database URL: (http://lpa.saogabriel.unipampa.edu.br: 8080/httdatabase/). Here, we present new features and updates of this unique database: (i) its expansion to include virus-host exchange of genetic material, which we called Horizontal Virus Transfer (HVT) and (ii) the availability of a web server for HT detection, where we implemented the online version of vertical and horizontal inheritance consistence analysis (VHICA), an R package developed for HT detection. These improvements will help researchers to navigate through known HVT cases, take data-informed decision and export figures based on keywords searches. Moreover, the availability of the VHICA as an online tool will make this software easily reachable even for researchers with no or little computation knowledge as well as foster our capability to detect new HT events in a wide variety of taxa.

Database URL: http://lpa.saogabriel.unipampa.edu.br:8080/httdatabase/

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<![CDATA[Increased circulating vascular endothelial growth factor in acute myeloid leukemia patients: a systematic review and meta-analysis]]> https://www.researchpad.co/article/N24f826e6-d5f9-4018-a449-43078d8294ee Vascular endothelial growth factor (VEGF) is one of the angiogenesis regulators, which plays an important role in tumor angiogenesis and tumor progression. Current studies have found that VEGF plays an important role in hematologic diseases including acute myeloid leukemia (AML). However, the circulating levels of VEGF in AML were still controversial among published studies.MethodsThree databases including PubMed, EMBASE, and Cochrane Library databases were searched up to February 2020. All articles included in the meta-analysis met our inclusion and exclusion criteria. Studies will be screened and data extracted by two independent investigators. The Newcastle-Ottawa Scale (NOS) and the Risk of Bias In Non-randomized Studies of Interventions (ROBINS-I) tool were applied to evaluate the quality of the included studies. A random-effects model was applied to pool the standardized mean difference (SMD). Heterogeneity test was performed by the Q statistic and quantified using I2. All statistical analysis was conducted in Stata 12.0 software.ResultsFourteen case-control studies were finally included in this systematic review and meta-analysis. Heterogeneity was high in our included studies (I2 = 91.1%, P < 0.001). Sensitivity analysis showed no significant change when any one study was excluded using random-effect methods (P > 0.05). Egger’s linear regression test showed that no publication bias existed (P > 0.05). Patients with AML, mainly those newly diagnosed and untreated, have higher VEGF levels (SMD = 0.85, 95% CI 0.28–1.42). Moreover, AML patients in n ≥ 40 group, plasma group, Asia and Africa group, and age ≥ 45 group had higher circulating VEGF levels (all P < 0.05).ConclusionsCompared to healthy controls, our meta-analysis shows a significantly higher level of circulating VEGF in AML patients, and it is associated with sample size, sample type, region, and age. ]]> <![CDATA[Journal Watch]]> https://www.researchpad.co/article/N28245775-963d-4566-aa90-3ee6315036c9 ]]> <![CDATA[Update on Ebola Treatment Center Costs and Sustainability, United States, 2019]]> https://www.researchpad.co/article/N3ca9f920-01df-415c-9e17-c33066de7b73

We surveyed 56 Ebola treatment centers (ETCs) in the United States and identified costs incurred since 2014 ($1.76 million/ETC) and sustainability strategies. ETCs reported heavy reliance on federal funding. It is uncertain if, or for how long, ETCs can maintain capabilities should federal funding expire in 2020.

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<![CDATA[A New Disease Emerges: Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)]]> https://www.researchpad.co/article/N298840da-4a5d-4d4a-9148-43d1d871e279 ]]> <![CDATA[Dysfonction immunitaire induite par la ventilation mécanique]]> https://www.researchpad.co/article/N0efc8372-36bf-40dd-9c2c-f226563425fe

Résumé

La ventilation mécanique (VM), même si elle fait partie de l’arsenal thérapeutique indispensable en réanimation, va induire ou aggraver des lésions pulmonaires. Les cellules du parenchyme pulmonaire ainsi que les cellules immunitaires du poumon vont être capables de convertir les forces mécaniques générées par la VM en un signal biologique qui va entraîner une réaction inflammatoire. Cette inflammation « stérile » locale puis systémique va entraîner une dysfonction du système immunitaire, source de morbidité et de mortalité pour le patient de réanimation.

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<![CDATA[Pneumonies virales acquises sous ventilation mécanique]]> https://www.researchpad.co/article/N1f06233e-1b3d-4bee-8866-d68f6f6ee3b5

Résumé

Les infections virales, notamment des voies respiratoires, ne sont pas rares chez les patients non immunodéprimés admis en réanimation. Des tests virologiques comme la polymerase chain reaction (PCR) sont largement disponibles et permettent un diagnostic rapide et efficace. Les Herpesviridae (herpès simplex virus et cytomégalovirus [CMV]) sont les virus les plus fréquemment détectés chez ces patients en réanimation. Cependant, une relation de causalité entre la détection de ces virus et leur éventuel impact en termes de morbimortalité restent controversés, avec un niveau de preuve variable en fonction des virus. Dans cette revue, nous détaillons les arguments en faveur du rôle de ces virus comme agents responsables de pneumonies nosocomiales acquises sous ventilation mécanique (VM) chez le patient non immunodéprimé. Nous discutons aussi des pistes physiopathologiques quant à la survenue de ces infections virales, ainsi que de la place d’un éventuel traitement antiviral.

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<![CDATA[Quels prélèvements aux urgences pour le diagnostic microbiologique d’une infection pulmonaire communautaire grave du sujet immunocompétent ?]]> https://www.researchpad.co/article/N778e4a98-8453-490f-b743-d906ad6a2de3

Résumé

Grâce aux méthodes de diagnostic actuelles, l’identification microbiologique des pneumonies communautaires graves (PCG) peut être établie dans la moitié des cas. Si les études épidémiologiques ont permis d’établir des recommandations préconisant l’antibiothérapie empirique à débuter, l’identification microbiologique du ou des pathogène(s) responsable(s) est nécessaire pour la conduite ultérieure du traitement. Les principaux examens à effectuer pour l’identification bactérienne sont la réalisation d’hémocultures, d’un examen cytobactériologique des sécrétions respiratoires et la recherche d’une antigénurie pneumococcique ou légionnelle. Les hémocultures sont positives dans 15 à 25 % des cas de PCG. L’examen cytobactériologique des crachats ou l’aspiration endotrachéale, chez le patient intubé, aide au diagnostic sous réserve que le prélèvement ne soit pas contaminé par la flore oropharyngée. La positivité d’une antigénurie est également fonction de la sévérité de la pneumonie. Cet examen permet un diagnostic rapide et n’est pas influencé par une antibiothérapie préalable. Les virus à tropisme respiratoire seraient responsables de 10 à 40 % des PCG. En période épidémique, des prélèvements par écouvillonnage nasal à la recherche du virus influenza sont recommandés, en raison du bénéfice attendu avec l’instauration d’un traitement par oseltamivir. Les sérologies permettant de faire le diagnostic de pneumonie à germes intracellulaires ont peu d’intérêt aux urgences de même que la réalisation de prélèvements sous fibroscopie bronchique. Enfin, la recherche qualitative par reverse transcriptase (PCR) sérique présente peu d’intérêt pour le diagnostic de pneumonie bactérienne par rapport aux méthodes usuelles.

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<![CDATA[La modulation de la signature transcriptomique de l’hôte infecté : une nouvelle stratégie thérapeutique dans les viroses graves ? Exemple de la grippe]]> https://www.researchpad.co/article/N3b3df941-9d3f-41e1-bc50-3b4fab8d7be8

Résumé

Ces dernières décennies ont été marquées par l’émergence ou la réémergence de virus responsables d’épidémies ou de pandémies plus ou moins sévères. Les stratégies préventives sont prises à défaut, et l’arsenal antiviral curatif est limité d’autant plus que les résistances virales peuvent apparaître rapidement. Par ailleurs, le développement de nouvelles molécules nécessite un délai incompatible avec la réponse rapide nécessaire lors d’une épidémie d’envergure ou d’une pandémie. C’est la raison pour laquelle de nouvelles approches thérapeutiques sont nécessaires. Un concept novateur est le repositionnement de molécules déjà sur le marché en exploitant leur capacité à inverser la réponse transcriptomique cellulaire de l’hôte infecté. En identifiant des molécules qui visent l’hôte et non le virus, cette stratégie permet d’avoir un large spectre d’action et d’être potentiellement actif sur de nouveaux variants. La mise en place de cette stratégie nécessite de caractériser les réponses cellulaires spécifiques de l’infection virale d’intérêt, de cribler in silico des molécules candidates, de les tester sur modèles cellulaires et animaux, avant d’envisager des essais cliniques chez l’homme. Nous présenterons cette démarche en prenant pour exemple l’infection grippale.

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<![CDATA[What are the boundaries of legal guardianship in Alzheimer’s disease? An evidence-based update in the context of the Brazilian Civil Code]]> https://www.researchpad.co/article/N1de32dd7-9062-422f-b25d-1107f4b2a46b

The Brazilian Civil Code, which came into force in 2002, established a functional criterion for guardianship proceedings and introduced the concept of “limited guardianship,” applied to cases in which incapacity to exercise civil rights is partial. With population aging and the growth in the number of older people with cognitive impairments, such as Alzheimer’s disease (AD), the need to invoke legal remedies against elder abuse increased; however, difficulties in assessing capacity still lead to a majority of decisions in favor of plenary guardianship. The present article compiled data on capacity in AD subjects. The varying degrees of decision-making impairment at different stages of AD might be compatible with limited guardianship in milder cases of the disease.

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<![CDATA[Place des micro-organismes atypiques et des virus dans les pneumonies aiguës communautaires sévères]]> https://www.researchpad.co/article/Nf1097a8c-586a-492e-82ba-7cef9476c73d

Résumé

L’attention des réanimateurs n’est guère attirée par les bactéries atypiques ou les virus dans le cadre des pneumonies communautaires sévères. Seules classiquement, Legionella pneumophila et les virus influenza, du fait de la pandémie grippale récente H1N1, restent présents dans la réflexion diagnostique. Pourtant, les pneumonies bactériennes atypiques ne sont pas rares, représentant jusqu’à 44 % des pneumonies communautaires. Considérées comme moins sévères que les pneumonies à bactéries pyogènes « typiques », 25 % d’entre elles justifient une hospitalisation, et 15 % présentent des critères de sepsis sévères. Si Legionella pneumophila est plus fréquemment en cause dans les formes graves, Mycoplasma pneumoniae peut être responsable de véritables défaillances multiviscérales. Les outils diagnostiques sont aujourd’hui performants (antigénurie légionelle et recherche en polymerase chain reaction [PCR] de mycoplasme en particulier) et permettent un diagnostic rapide et précoce. Le traitement est bien codifié et repose sur les macrolides ou les fluoroquinolones, en association dans les formes graves de légionellose. Le rôle des virus au cours des pneumonies communautaires sévères, seuls ou associés à des bactéries, devient de plus en plus établi grâce aux méthodes de diagnostic rapide de biologie moléculaire. Ces techniques ont permis la mise en évidence dans ces pneumonies de nombreux et nouveaux virus. Toute la question est désormais à l’imputabilité clinique de ces résultats biologiques très performants et donc à la décision d’instaurer ou non un traitement antiviral dont l’efficacité dans les formes sévères reste discutable.

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<![CDATA[Prise en charge multidisciplinaire des pneumopathies nécrosantes ventilées]]> https://www.researchpad.co/article/N16c819b0-0d4e-42b9-82c5-fb2e490ce6ef

Résumé

Les pneumopathies infectieuses peuvent se compliquer, du fait de facteurs liés aux germes, à l’hôte ou à l’interaction entre les deux, par la survenue d’une nécrose et/ou d’une destruction du parenchyme pulmonaire. La nécrose et la destruction du parenchyme pulmonaire sont à l’origine de deux entités cliniques principales, les abcès pulmonaires et les pneumonies nécrosantes (PN). Les PN sont des entités rares mais dont le pronostic est redoutable. Elles sont caractérisées par une hépatisation diffuse, possiblement bilatérale du parenchyme pulmonaire avec cavitations et nécrose. Les PN sont généralement associées à un sepsis sévère et à une insuffisance respiratoire aiguë. Nous envisagerons la physiopathologie et le traitement médical qui comprend des mesures symptomatiques, le support des différentes défaillances d’organe, en particulier respiratoires, et le traitement antibiotique. Les indications chirurgicales et leurs modalités seront aussi détaillées. Une prise en charge multidisciplinaire associant réanimateurs, pneumologues, infectiologues, radiologues, chirurgiens et kinésithérapeutes doit permettre d’améliorer les taux de survie et surtout la qualité de vie des patients à distance d’une PN.

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<![CDATA[Formes graves de la grippe H1N1 2009 chez l’adulte: l’expérience française]]> https://www.researchpad.co/article/N4abd025c-5036-4714-9ddb-ca3c814bb847

Résumé

Le registre Reva-Grippe-SRLF a permis de colliger les données de 562 patients infectés par le virus grippal H1N1 2009 et hospitalisés en réanimation. La mortalité globale de ces patients a été de 20 %. Le recours à la ventilation invasive, l’insuffisance cardiaque, l’immunodépression étaient associés à la mortalité. Trois cent quarante et un (82 %) des 417 patients ventilés présentaient un syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA). Cent soixante-neuf (30 %) présentaient une co-infection bactérienne. La corticothérapie était associée à une surmortalité chez les patients atteints de SDRA. Le taux d’occupation lié aux patients grippés a franchi le seuil de 15 % dans de nombreux services de réanimation.

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<![CDATA[Early respiratory manifestations of severe burn patient]]> https://www.researchpad.co/article/Ncd7ef6a6-094e-434c-9701-df640890f900

Respiratory dysfunction with hypoxemia is common in early phase of severe burn, with or without smoke inhalation injury. In this article, we discuss the mechanisms associated with the occurrence of pulmonary injury in burn intensive care patients, diagnostics approaches and therapeutics options to be implemented based on identified causes.

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<![CDATA[Faut-il contrôler la fièvre dans les infections sévères ?]]> https://www.researchpad.co/article/N486c0f5d-602e-44da-a7b1-b5000fe523b8

Résumé

Le contrôle de la fièvre lors des sepsis graves est couramment utilisé en réanimation, respectivement dans 66 et 70 % des états septiques graves et des chocs septiques. Pourtant, les preuves formelles quant au bénéfice d’une telle stratégie manquent. On peut s’interroger à la lumière de travaux expérimentaux parfois anciens et d’études observationnelles plus récentes des risques d’un contrôle sur le cours évolutif de l’infection, le devenir du patient, ainsi que sur l’innocuité des traitements appliqués pour obtenir le contrôle. Néanmoins, dans certaines situations, la fièvre peut être délétère, en lien avec une consommation en oxygène (O2) accrue et le risque d’ischémie tissulaire et/ou une réaction inflammatoire focale exacerbée. Chez des patients septiques, le contrôle de la fièvre fait appel à des moyens physiques (refroidissement externe et/ou interne) et/ou pharmacologiques (essentiellement le paracétamol et/ou des anti-inflammatoires non stéroïdiens). Malgré les incertitudes quant au bénéfice ou non à contrôler la température, il faut certainement s’affranchir des températures extrêmes (hypoou hyperthermie) et évaluer individuellement le rapport bénéfice/risque.

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<![CDATA[Veterinary Immunology and Serology: Clinical Laboratory Diagnostics]]> https://www.researchpad.co/article/N7c6fe267-bb7b-4ee2-a22f-74b0cd0ee243

Abstract

Methods used in clinical laboratory diagnosis in the veterinary laboratory closely parallel the common techniques used in the human laboratory. Immunology procedures include immunohematology, autoimmune testing, and assays for detection of immune deficiencies and infectious diseases. Veterinary immunohematology procedures deal with immune-mediated hemolysis, as well as blood typing, cross matching, and transfusion. Diseases of the immune system in animals include rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus (SLE), and immunodeficiency disorders. The number of infectious diseases that can be diagnosed in a veterinary laboratory is almost limitless, but perhaps two of the most prevalent and significant are heartworm disease and feline infectious peritonitis (FIP).

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